El Archivo General recibe periódicamente documentación de las facultades. La más voluminosa son los expedientes académicos de los alumnos.

Parte de la documentación generada por la Secretaría General tras su traslado al pabellón de gobierno en los años cincuenta fue trasladada provisionalmente a la Facultad de Derecho.

Los ficheros constituyen un elemento esencial en la recuperación de la información en los archivos en papel.

Las cartelas son trozos de cartón o madera, usados para identificar los expedientes contenidos en los legajos. En este caso identifican la correspondencia de la Escuela con el Ministerio de Fomento.

Tras el final de la Guerra, se proyecta la reconstrucción de los edificios de la Ciudad Universitaria de Madrid. El proyecto conservaba muchos elementos del original, pero con un nuevo discurso arquitectónico.

La Ciudad Universitaria de Madrid se convirtió en frente de la defensa de la capital desde los primeros meses de la Guerra. La Facultad de Filosofía estuvo ocupada por tropas de los dos bandos.

En la década de los cincuenta del siglo XX, el rectorado de la Universidad, la secretaría general y otras dependencias se trasladaron desde la sede de San Bernardo al edificio de la calle Isaac Peral proyectado por Sánchez Arcas.

En 1858 se crea el Archivo General del Reino en Alcalá de Henares.