La Universidad Cisneriana, un símbolo del Antiguo Régimen

Siguiendo el modelo de colegio-Universidad, tiene lugar la fundación de la Universidad de Alcalá de Henares por el cardenal Francisco Jiménez de Cisneros, tras la expedición de la bula fundacional expedida por el papa Alejandro VI el 13 de abril de 1499, comenzando su andadura en 1508. El colegio de San Ildefonso será sede de la comunidad colegial y cabeza de la universidad.

La Universidad cisneriana, de inspiración eclesiástica en lo jurisdiccional, ideológico y espiritual, será heredera de las escuelas catedralicias, fundamentalmente en una primera época en la que se priorizarán los estudios de Teología.