El proyecto de concentrar las facultades y demás dependencias universitarias en un único campus se vio truncado por la Guerra Civil. La Ciudad Universitaria se convierte en frente de la defensa de Madrid desde los primeros meses de la contienda. Finalizada esta, la Ley de Universidades de 1943 fracturó las competencias sobre el patrimonio documental entre la Biblioteca y la Secretaría General, lo que agudizó la indefinición del Archivo.
Imagen parcial del Plano del edificio de la Facultad de Filosofía, de Agustín Aguirre, en el que puede verse el espacio destinado a archivo.
Fotografía de una estancia de la Facultad de Filosofía durante la Guerra publicada en la revista Le Patriote Illustré, de 7 de noviembre de 1937
Copia del oficio de remisión al Jefe de Archivos y Bibliotecas del informe del estado de los locales en la sede de San Bernardo
Folleto de propaganda de la reconstrucción de la Ciudad Universitaria tras la Guerra Civil.